Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMURF1Q9HCE7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMURF1Q9HCE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF1Q9HCE7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMURF1Q9HCE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF1Q9HCE7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms