Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVMER34-1Q9H9K5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVMER34-1Q9H9K5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVMER34-1Q9H9K5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVMER34-1Q9H9K5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms