Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPHX3Q9H6B9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPHX3Q9H6B9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPHX3Q9H6B9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHX3Q9H6B9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHX3Q9H6B9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHX3Q9H6B9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHX3Q9H6B9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHX3Q9H6B9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHX3Q9H6B9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHX3Q9H6B9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms