Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS5Q9H3S3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS5Q9H3S3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMPRSS5Q9H3S3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS5Q9H3S3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS5Q9H3S3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS5Q9H3S3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS5Q9H3S3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms