Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPHQ9H3R5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPHQ9H3R5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPHQ9H3R5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPHQ9H3R5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPHQ9H3R5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPHQ9H3R5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPHQ9H3R5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPHQ9H3R5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPHQ9H3R5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPHQ9H3R5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPHQ9H3R5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPHQ9H3R5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPHQ9H3R5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPHQ9H3R5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CENPHQ9H3R5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPHQ9H3R5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPHQ9H3R5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms