Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC13Q9H3R2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC13Q9H3R2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC13Q9H3R2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC13Q9H3R2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC13Q9H3R2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC13Q9H3R2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MUC13Q9H3R2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC13Q9H3R2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC13Q9H3R2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC13Q9H3R2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC13Q9H3R2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC13Q9H3R2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC13Q9H3R2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms