Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MIXL1Q9H2W2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIXL1Q9H2W2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIXL1Q9H2W2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIXL1Q9H2W2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIXL1Q9H2W2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MIXL1Q9H2W2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MIXL1Q9H2W2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIXL1Q9H2W2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIXL1Q9H2W2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIXL1Q9H2W2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIXL1Q9H2W2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms