Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM38Q9H0Z9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM38Q9H0Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM38Q9H0Z9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM38Q9H0Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM38Q9H0Z9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM38Q9H0Z9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM38Q9H0Z9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM38Q9H0Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RBM38Q9H0Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM38Q9H0Z9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM38Q9H0Z9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM38Q9H0Z9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms