Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC90BQ9GZT6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC90BQ9GZT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC90BQ9GZT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC90BQ9GZT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC90BQ9GZT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC90BQ9GZT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC90BQ9GZT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC90BQ9GZT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC90BQ9GZT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC90BQ9GZT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms