Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR12Q9GZL7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR12Q9GZL7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR12Q9GZL7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR12Q9GZL7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR12Q9GZL7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR12Q9GZL7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR12Q9GZL7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR12Q9GZL7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR12Q9GZL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR12Q9GZL7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR12Q9GZL7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR12Q9GZL7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR12Q9GZL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR12Q9GZL7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms