Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM15Q9C019 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM15Q9C019 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM15Q9C019 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM15Q9C019 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM15Q9C019 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM15Q9C019 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM15Q9C019 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM15Q9C019 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM15Q9C019 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM15Q9C019 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM15Q9C019 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM15Q9C019 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM15Q9C019 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms