Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM4Q9BWF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM4Q9BWF3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM4Q9BWF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM4Q9BWF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM4Q9BWF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM4Q9BWF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM4Q9BWF3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM4Q9BWF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM4Q9BWF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM4Q9BWF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM4Q9BWF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM4Q9BWF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms