Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD10Q9BUL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD10Q9BUL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD10Q9BUL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCD10Q9BUL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD10Q9BUL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD10Q9BUL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD10Q9BUL8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD10Q9BUL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD10Q9BUL8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD10Q9BUL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD10Q9BUL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms