Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms