Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN2AQ99865 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN2AQ99865 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN2AQ99865 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN2AQ99865 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN2AQ99865 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN2AQ99865 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIN2AQ99865 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN2AQ99865 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms