Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UHRF1Q96T88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UHRF1Q96T88 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UHRF1Q96T88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UHRF1Q96T88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UHRF1Q96T88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UHRF1Q96T88 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UHRF1Q96T88 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UHRF1Q96T88 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UHRF1Q96T88 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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