Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNKPQ96T60 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNKPQ96T60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNKPQ96T60 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNKPQ96T60 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PNKPQ96T60 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNKPQ96T60 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNKPQ96T60 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms