Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00479Q96M42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00479Q96M42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00479Q96M42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00479Q96M42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00479Q96M42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00479Q96M42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms