Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAC1Q96KF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PRAC1Q96KF2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAC1Q96KF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PRAC1Q96KF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PRAC1Q96KF2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms