Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UFD1Q92890 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UFD1Q92890 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UFD1Q92890 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UFD1Q92890 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFD1Q92890 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFD1Q92890 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UFD1Q92890 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFD1Q92890 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UFD1Q92890 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms