Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3S1Q92572 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3S1Q92572 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S1Q92572 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3S1Q92572 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3S1Q92572 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3S1Q92572 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms