Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATRIPQ8WXE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATRIPQ8WXE1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATRIPQ8WXE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATRIPQ8WXE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATRIPQ8WXE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATRIPQ8WXE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATRIPQ8WXE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATRIPQ8WXE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATRIPQ8WXE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms