Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC13Q8WW36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC13Q8WW36 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZCCHC13Q8WW36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms