Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKUQ8WUA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSKUQ8WUA8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSKUQ8WUA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSKUQ8WUA8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSKUQ8WUA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSKUQ8WUA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSKUQ8WUA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms