Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CADM4Q8NFZ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CADM4Q8NFZ8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CADM4Q8NFZ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CADM4Q8NFZ8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CADM4Q8NFZ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CADM4Q8NFZ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CADM4Q8NFZ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CADM4Q8NFZ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms