Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST4Q8NFU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEST4Q8NFU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEST4Q8NFU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEST4Q8NFU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST4Q8NFU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST4Q8NFU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms