Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ2

AMIGO2, Amphoterin-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO2Q86SJ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AMIGO2Q86SJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMIGO2Q86SJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMIGO2Q86SJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMIGO2Q86SJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMIGO2Q86SJ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMIGO2Q86SJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMIGO2Q86SJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AMIGO2Q86SJ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMIGO2Q86SJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMIGO2Q86SJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMIGO2Q86SJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMIGO2Q86SJ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms