Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPGP1Q6ZNW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDPGP1Q6ZNW5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDPGP1Q6ZNW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPGP1Q6ZNW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPGP1Q6ZNW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDPGP1Q6ZNW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPGP1Q6ZNW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPGP1Q6ZNW5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms