Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAAP20Q6NZ36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAAP20Q6NZ36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAAP20Q6NZ36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAAP20Q6NZ36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAAP20Q6NZ36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAAP20Q6NZ36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAAP20Q6NZ36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms