Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM41BQ5BJD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM41BQ5BJD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41BQ5BJD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM41BQ5BJD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM41BQ5BJD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms