Protein–RNA interactions for Protein: Q53HV7

SMUG1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMUG1Q53HV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMUG1Q53HV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMUG1Q53HV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMUG1Q53HV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMUG1Q53HV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMUG1Q53HV7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMUG1Q53HV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMUG1Q53HV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMUG1Q53HV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms