Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAL1Q4LDG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAL1Q4LDG9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAL1Q4LDG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAL1Q4LDG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAL1Q4LDG9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAL1Q4LDG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAL1Q4LDG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAL1Q4LDG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms