Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2CD3Q4AC94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2CD3Q4AC94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD3Q4AC94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD3Q4AC94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD3Q4AC94 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD3Q4AC94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD3Q4AC94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms