Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF212Q495C1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF212Q495C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF212Q495C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF212Q495C1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF212Q495C1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF212Q495C1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF212Q495C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF212Q495C1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF212Q495C1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF212Q495C1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF212Q495C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF212Q495C1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF212Q495C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF212Q495C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF212Q495C1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF212Q495C1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF212Q495C1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms