Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMN1Q16637 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMN1Q16637 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMN1Q16637 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMN1Q16637 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMN1Q16637 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMN1Q16637 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMN1Q16637 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMN1Q16637 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMN1Q16637 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms