Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.73e-23■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-23■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-23■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.93e-23■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 PPP3CC-206ENST00000522000 460 ntTSL 217.36■□□□□ 0.373e-23■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 DENND5A-205ENST00000526707 2861 ntTSL 218.54■□□□□ 0.562e-19■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-19■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 DENND5A-206ENST00000527700 3593 ntTSL 27.56□□□□□ -1.22e-19■■■■■ 88.6
PCBP2Q15366 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 88.2
PCBP2Q15366 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 88.2
PCBP2Q15366 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 88.2
PCBP2Q15366 FAM234B-202ENST00000416494 2623 ntTSL 211.33□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 88
PCBP2Q15366 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 88
PCBP2Q15366 FAM234B-204ENST00000537625 2011 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 88
PCBP2Q15366 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 88
PCBP2Q15366 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 88
PCBP2Q15366 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 88
PCBP2Q15366 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-36■■■■■ 88
PCBP2Q15366 USP9Y-202ENST00000426564 9118 ntTSL 24.12□□□□□ -1.752e-22■■■■■ 87.8
PCBP2Q15366 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-22■■■■■ 87.8
PCBP2Q15366 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 411.63□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 87.5
PCBP2Q15366 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 320.25■□□□□ 0.835e-22■■■■■ 87.5
PCBP2Q15366 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.717e-11■■■■■ 87.3
PCBP2Q15366 MHENCR-201ENST00000411579 582 ntTSL 219.27■□□□□ 0.682e-17■■■■■ 86.7
PCBP2Q15366 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-17■■■■■ 86.7
PCBP2Q15366 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 86.5
PCBP2Q15366 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.981e-73■■■■■ 86.1
PCBP2Q15366 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.021e-73■■■■■ 86.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-210ENST00000594521 826 ntTSL 515.74■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 86.1
PCBP2Q15366 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 85.7
PCBP2Q15366 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-10■■■■■ 85.7
PCBP2Q15366 PIEZO2-212ENST00000582913 8465 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-10■■■■■ 85.7
PCBP2Q15366 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 85.7
PCBP2Q15366 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.031e-10■■■■■ 85.7
PCBP2Q15366 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.664e-16■■■■■ 85.4
PCBP2Q15366 UBP1-208ENST00000467613 659 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-18■■■■■ 85.3
PCBP2Q15366 UBP1-203ENST00000411650 859 ntTSL 54.4□□□□□ -1.712e-18■■■■■ 85.3
PCBP2Q15366 UBP1-210ENST00000486388 928 ntTSL 34.36□□□□□ -1.712e-18■■■■■ 85.3
PCBP2Q15366 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.928e-11■■■■■ 85.3
PCBP2Q15366 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.148e-11■■■■■ 85.3
PCBP2Q15366 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 310.31□□□□□ -0.769e-43■■■■■ 85.1
PCBP2Q15366 UBE2E1-207ENST00000475680 1138 ntTSL 519.31■□□□□ 0.682e-20■■■■■ 85
PCBP2Q15366 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-20■■■■■ 85
PCBP2Q15366 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-20■■■■■ 85
PCBP2Q15366 UBE2E1-211ENST00000495141 582 ntTSL 215.61■□□□□ 0.092e-20■■■■■ 85
PCBP2Q15366 UBE2E1-204ENST00000442670 622 ntTSL 215.55■□□□□ 0.082e-20■■■■■ 85
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PCBP2Q15366 UBE2E1-206ENST00000467766 585 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-20■■■■■ 85
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PCBP2Q15366 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-15■■■■■ 84.7
PCBP2Q15366 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.319e-21■■■■■ 84.4
PCBP2Q15366 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-21■■■■■ 84.4
PCBP2Q15366 CASC4-206ENST00000558847 622 ntTSL 35.75□□□□□ -1.499e-21■■■■■ 84.4
PCBP2Q15366 LIN7A-201ENST00000261203 989 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.036e-18■■■■■ 84.4
PCBP2Q15366 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.286e-18■■■■■ 84.4
PCBP2Q15366 ZFP30-206ENST00000587199 557 ntTSL 416.31■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ZFP30-210ENST00000589676 598 ntTSL 314.57□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ZNF781-204ENST00000593040 527 ntTSL 313.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ZNF781-203ENST00000590008 2148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ZFP30-205ENST00000586732 673 ntTSL 311.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.499e-23■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.269e-23■■■■■ 84.3
PCBP2Q15366 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 84.1
PCBP2Q15366 CMPK1-202ENST00000371871 1212 ntTSL 220.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 CMPK1-201ENST00000371870 812 ntTSL 217■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 MAP2K5-212ENST00000560591 1457 ntTSL 36□□□□□ -1.451e-40■■■■■ 83.8
PCBP2Q15366 RNF44-204ENST00000506378 848 ntTSL 216.76■□□□□ 0.276e-11■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 223.56■■□□□ 1.366e-11■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 EXOC3L4-206ENST00000560304 657 ntTSL 320.58■□□□□ 0.896e-11■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 EXOC3L4-204ENST00000559693 813 ntTSL 316.96■□□□□ 0.316e-11■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 414.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 411.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 49.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 83.2
PCBP2Q15366 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 82.7
PCBP2Q15366 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 28.45□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 82.7
PCBP2Q15366 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 214.13□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 82.7
PCBP2Q15366 SFXN2-203ENST00000480358 2315 ntTSL 513.58□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 82.7
PCBP2Q15366 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 82.7
PCBP2Q15366 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 511.71□□□□□ -0.534e-13■■■■■ 82.5
PCBP2Q15366 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 82.2
PCBP2Q15366 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 81.9
PCBP2Q15366 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 517.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 81.7
PCBP2Q15366 NUBPL-204ENST00000548937 578 ntTSL 316.12■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 81.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 536.2 ms