Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLINT1Q14677 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLINT1Q14677 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLINT1Q14677 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLINT1Q14677 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLINT1Q14677 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLINT1Q14677 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLINT1Q14677 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLINT1Q14677 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLINT1Q14677 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLINT1Q14677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLINT1Q14677 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms