Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIPK1Q13546 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK1Q13546 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIPK1Q13546 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIPK1Q13546 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RIPK1Q13546 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK1Q13546 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPK1Q13546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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