Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5R2Q13319 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5R2Q13319 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5R2Q13319 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5R2Q13319 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5R2Q13319 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5R2Q13319 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5R2Q13319 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5R2Q13319 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK5R2Q13319 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5R2Q13319 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5R2Q13319 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5R2Q13319 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5R2Q13319 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms