Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 HOL1YNR055C 1761 nt9.41□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.39□□□□□ -0.91
NOP56Q12460 ADO1YJR105W 1023 nt9.39□□□□□ -0.91
NOP56Q12460 HHO1YPL127C 777 nt9.38□□□□□ -0.91
NOP56Q12460 YGR201CYGR201C 678 nt9.37□□□□□ -0.91
NOP56Q12460 ALG3YBL082C 1377 nt9.37□□□□□ -0.91 RIP-Chip
NOP56Q12460 RBG1YAL036C 1110 nt9.34□□□□□ -0.91
NOP56Q12460 YLR415CYLR415C 339 nt9.33□□□□□ -0.92
NOP56Q12460 PSD1YNL169C 1503 nt9.31□□□□□ -0.92
NOP56Q12460 BDH1YAL060W 1149 nt9.29□□□□□ -0.92
NOP56Q12460 SFL1YOR140W 2301 nt9.29□□□□□ -0.92 RIP-Chip
NOP56Q12460 CYT1YOR065W 930 nt9.28□□□□□ -0.92
NOP56Q12460 YOR072WYOR072W 315 nt9.27□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 Q0010Q0010 387 nt9.27□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 AGP1YCL025C 1902 nt9.27□□□□□ -0.93 RIP-Chip
NOP56Q12460 XDJ1YLR090W 1380 nt9.25□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 YLR173WYLR173W 1827 nt9.24□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 PCP1YGR101W 1041 nt9.24□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 ALR1YOL130W 2580 nt9.24□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 MET8YBR213W 825 nt9.23□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 TIM17YJL143W 477 nt9.22□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 GDH3YAL062W 1374 nt9.22□□□□□ -0.93
NOP56Q12460 MDL2YPL270W 2322 nt9.21□□□□□ -0.93 RIP-Chip
NOP56Q12460 RTN2YDL204W 1182 nt9.21□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 GOR1YNL274C 1053 nt9.21□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 RTG2YGL252C 1767 nt9.21□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 YSP3YOR003W 1437 nt9.21□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 AVT6YER119C 1347 nt9.2□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 YJR154WYJR154W 1041 nt9.19□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 HIS2YFR025C 1008 nt9.18□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 CLB6YGR109C 1143 nt9.18□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 SHM2YLR058C 1410 nt9.16□□□□□ -0.94
NOP56Q12460 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.13□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 PEX25YPL112C 1185 nt9.13□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 LPD1YFL018C 1500 nt9.13□□□□□ -0.95 RIP-Chip
NOP56Q12460 THI6YPL214C 1623 nt9.13□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.12□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.12□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 STR3YGL184C 1398 nt9.12□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 YRF1-2YER190W 5046 nt9.11□□□□□ -0.95 RIP-Chip
NOP56Q12460 YNL115CYNL115C 1935 nt9.11□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 DAT1YML113W 747 nt9.1□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 VPS75YNL246W 795 nt9.09□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 DUT1YBR252W 444 nt9.09□□□□□ -0.95
NOP56Q12460 MEX67YPL169C 1800 nt9.08□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 YFR018CYFR018C 1092 nt9.07□□□□□ -0.96 RIP-Chip
NOP56Q12460 AQY2YLL052C 450 nt9.07□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 ALD4YOR374W 1560 nt9.07□□□□□ -0.96 RIP-Chip
NOP56Q12460 HIF1YLL022C 1158 nt9.06□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 MCM5YLR274W 2328 nt9.06□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 DUR3YHL016C 2208 nt9.05□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 NIT1YIL164C 600 nt9.05□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 GCD11YER025W 1584 nt9.04□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 GAP1YKR039W 1809 nt9.04□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 YCR102CYCR102C 1107 nt9.04□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 UGP1YKL035W 1500 nt9.04□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 SGT2YOR007C 1041 nt9.03□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 DMA2YNL116W 1569 nt9.03□□□□□ -0.96
NOP56Q12460 ZRT3YKL175W 1512 nt9.02□□□□□ -0.97
NOP56Q12460 UFD1YGR048W 1086 nt9.02□□□□□ -0.97
NOP56Q12460 YFL066CYFL066C 1179 nt8.99□□□□□ -0.97 RIP-Chip
NOP56Q12460 YDR094WYDR094W 336 nt8.98□□□□□ -0.97
NOP56Q12460 YNL024CYNL024C 741 nt8.97□□□□□ -0.97
NOP56Q12460 RRT5YFR032C 870 nt8.96□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 NBP35YGL091C 987 nt8.96□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 PAU7YAR020C 168 nt8.96□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 LSB5YCL034W 1065 nt8.96□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.94□□□□□ -0.98 RIP-Chip
NOP56Q12460 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.94□□□□□ -0.98 RIP-Chip
NOP56Q12460 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.94□□□□□ -0.98 RIP-Chip
NOP56Q12460 ADE2YOR128C 1716 nt8.94□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 YHR218WYHR218W 1812 nt8.93□□□□□ -0.98 RIP-Chip
NOP56Q12460 ECM10YEL030W 1935 nt8.93□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 DAK2YFL053W 1776 nt8.92□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 ARP6YLR085C 1317 nt8.91□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 COQ8YGL119W 1506 nt8.9□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 SNU66YOR308C 1764 nt8.9□□□□□ -0.98
NOP56Q12460 FIT1YDR534C 1587 nt8.9□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 PRE6YOL038W 765 nt8.89□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 LSC2YGR244C 1284 nt8.88□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 TIR3YIL011W 810 nt8.88□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 MAM3YOL060C 2121 nt8.88□□□□□ -0.99 RIP-Chip
NOP56Q12460 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.88□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 MAS1YLR163C 1389 nt8.86□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 MET30YIL046W 1923 nt8.86□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 PRM5YIL117C 957 nt8.85□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 YOR325WYOR325W 474 nt8.85□□□□□ -0.99
NOP56Q12460 PLB1YMR008C 1995 nt8.84□□□□□ -0.99 RIP-Chip
NOP56Q12460 RSC8YFR037C 1674 nt8.82□□□□□ -1 RIP-Chip
NOP56Q12460 YGR139WYGR139W 339 nt8.82□□□□□ -1
NOP56Q12460 SHB17YKR043C 816 nt8.82□□□□□ -1
NOP56Q12460 GNP1YDR508C 1992 nt8.82□□□□□ -1 RIP-Chip
NOP56Q12460 PAB1YER165W 1734 nt8.81□□□□□ -1
NOP56Q12460 SAM35YHR083W 990 nt8.81□□□□□ -1
NOP56Q12460 MIR1YJR077C 936 nt8.81□□□□□ -1
NOP56Q12460 PAU16YKL224C 372 nt8.81□□□□□ -1
NOP56Q12460 YNL190WYNL190W 615 nt8.81□□□□□ -1
NOP56Q12460 YJL067WYJL067W 351 nt8.8□□□□□ -1
NOP56Q12460 YDR010CYDR010C 333 nt8.79□□□□□ -1
NOP56Q12460 YML089CYML089C 369 nt8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms