Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 UGP1YKL035W 1500 nt7.73□□□□□ -1.17
TPT1Q12272 YOR325WYOR325W 474 nt7.71□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 CCT4YDL143W 1587 nt7.71□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 COQ8YGL119W 1506 nt7.7□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 THI72YOR192C 1800 nt7.7□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 ARP6YLR085C 1317 nt7.7□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 FRA1YLL029W 2250 nt7.69□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 PSD1YNL169C 1503 nt7.69□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 YLR235CYLR235C 399 nt7.69□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 TIM23YNR017W 669 nt7.69□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.68□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 NRT1YOR071C 1797 nt7.67□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 AHT1YHR093W 549 nt7.66□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 YLR179CYLR179C 606 nt7.66□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 SWC5YBR231C 912 nt7.66□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 PTH1YHR189W 573 nt7.65□□□□□ -1.18
TPT1Q12272 UTR1YJR049C 1593 nt7.64□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.63□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 CYT1YOR065W 930 nt7.62□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 HXK1YFR053C 1458 nt7.62□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 ARO8YGL202W 1503 nt7.61□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 NBP35YGL091C 987 nt7.59□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 SAM35YHR083W 990 nt7.59□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 OPI10YOL032W 741 nt7.59□□□□□ -1.19
TPT1Q12272 ALD5YER073W 1563 nt7.59□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 SGA1YIL099W 1650 nt7.58□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 SPP1YPL138C 1062 nt7.58□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 DMA2YNL116W 1569 nt7.58□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 KES1YPL145C 1305 nt7.57□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 NSG2YNL156C 900 nt7.57□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 RSC8YFR037C 1674 nt7.55□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 YKL030WYKL030W 606 nt7.55□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 DAT1YML113W 747 nt7.55□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 GNP1YDR508C 1992 nt7.54□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 YPR064WYPR064W 420 nt7.54□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 BET2YPR176C 978 nt7.53□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 CCT2YIL142W 1584 nt7.53□□□□□ -1.2
TPT1Q12272 ZAP1YJL056C 2643 nt7.51□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 NME1NME1 340 nt7.51□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 YHR218WYHR218W 1812 nt7.5□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 TAD3YLR316C 969 nt7.5□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 SHM2YLR058C 1410 nt7.5□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 SHY1YGR112W 1170 nt7.48□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 DBP1YPL119C 1854 nt7.48□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 LSB6YJL100W 1824 nt7.48□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 GAP1YKR039W 1809 nt7.48□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 HXT1YHR094C 1713 nt7.47□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 YCR102CYCR102C 1107 nt7.47□□□□□ -1.21
TPT1Q12272 YLR173WYLR173W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 CWC15YDR163W 528 nt7.45□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 PCP1YGR101W 1041 nt7.44□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 BDH1YAL060W 1149 nt7.44□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 TOM71YHR117W 1920 nt7.44□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 MEP3YPR138C 1470 nt7.43□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 YOR072WYOR072W 315 nt7.43□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 ODC1YPL134C 933 nt7.43□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 YDR306CYDR306C 1437 nt7.43□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 MRP20YDR405W 792 nt7.42□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 NIT1YIL164C 600 nt7.41□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 MTO1YGL236C 2010 nt7.4□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 LSC2YGR244C 1284 nt7.4□□□□□ -1.22
TPT1Q12272 YLR415CYLR415C 339 nt7.39□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 TPN1YGL186C 1740 nt7.38□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 TIM17YJL143W 477 nt7.38□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 RTG2YGL252C 1767 nt7.37□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 URA6YKL024C 615 nt7.36□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 QDR2YIL121W 1629 nt7.35□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 SSL2YIL143C 2532 nt7.35□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 MEX67YPL169C 1800 nt7.34□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.34□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 RTG1YOL067C 534 nt7.34□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 ZTA1YBR046C 1005 nt7.34□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 YSP3YOR003W 1437 nt7.34□□□□□ -1.23
TPT1Q12272 HXT10YFL011W 1641 nt7.34□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 MDL2YPL270W 2322 nt7.33□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 PRO1YDR300C 1287 nt7.33□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 TIR3YIL011W 810 nt7.33□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 DIF1YLR437C 402 nt7.33□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 MDM35YKL053C-A 261 nt7.32□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 SGT2YOR007C 1041 nt7.32□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 SNU66YOR308C 1764 nt7.32□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 YBL086CYBL086C 1401 nt7.32□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 GID8YMR135C 1368 nt7.32□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 UFO1YML088W 2007 nt7.29□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 Q0010Q0010 387 nt7.29□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 MRS6YOR370C 1812 nt7.29□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 NBA1YOL070C 1506 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 RET2YFR051C 1641 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 ADE2YOR128C 1716 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 YJR154WYJR154W 1041 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 SHH4YLR164W 507 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 ACH1YBL015W 1581 nt7.28□□□□□ -1.24
TPT1Q12272 SHB17YKR043C 816 nt7.27□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 DIG1YPL049C 1359 nt7.27□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 THI6YPL214C 1623 nt7.27□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 SFL1YOR140W 2301 nt7.26□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 YKL133CYKL133C 1392 nt7.26□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 LIP1YMR298W 453 nt7.26□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 YRF1-2YER190W 5046 nt7.26□□□□□ -1.25
TPT1Q12272 ATG15YCR068W 1563 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms