Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 ESS1YJR017C 513 nt11.64□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 SFA1YDL168W 1161 nt11.63□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 CPD1YGR247W 720 nt11.62□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 RPS14BYJL191W 417 nt11.62□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 RIB3YDR487C 627 nt11.61□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 YGR012WYGR012W 1182 nt11.59□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 AVT6YER119C 1347 nt11.59□□□□□ -0.55
TYW1Q08960 NAP1YKR048C 1254 nt11.58□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 YJL118WYJL118W 660 nt11.57□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 UTH1YKR042W 1098 nt11.57□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 TSC10YBR265W 963 nt11.57□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 HHO1YPL127C 777 nt11.56□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 CAB5YDR196C 726 nt11.55□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 YEL008WYEL008W 381 nt11.55□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 YGR201CYGR201C 678 nt11.54□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 SEN2YLR105C 1134 nt11.54□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 ADH1YOL086C 1047 nt11.54□□□□□ -0.56
TYW1Q08960 LYS4YDR234W 2082 nt11.52□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 YCR102CYCR102C 1107 nt11.52□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 GOR1YNL274C 1053 nt11.51□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 MIC12YBR262C 321 nt11.51□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 PAB1YER165W 1734 nt11.49□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 PUP1YOR157C 786 nt11.49□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 NVJ2YPR091C 2313 nt11.48□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 YPI1YFR003C 468 nt11.47□□□□□ -0.57
TYW1Q08960 HMT1YBR034C 1047 nt11.43□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.43□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 NRT1YOR071C 1797 nt11.43□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 SEC11YIR022W 504 nt11.42□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 RAX1YOR301W 1308 nt11.41□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 PEX2YJL210W 816 nt11.41□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.4□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 TOM6YOR045W 186 nt11.4□□□□□ -0.58
TYW1Q08960 NCP1YHR042W 2076 nt11.36□□□□□ -0.59
TYW1Q08960 YHM2YMR241W 945 nt11.35□□□□□ -0.59
TYW1Q08960 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.35□□□□□ -0.59
TYW1Q08960 AAC1YMR056C 930 nt11.34□□□□□ -0.59
TYW1Q08960 HIP1YGR191W 1812 nt11.34□□□□□ -0.59
TYW1Q08960 VAR1Q0140 1197 nt11.33□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 COG1YGL223C 1254 nt11.33□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 YJR114WYJR114W 393 nt11.32□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 LOT5YKL183W 921 nt11.32□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 SHH4YLR164W 507 nt11.32□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 BDF1YLR399C 2061 nt11.32□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 TIR3YIL011W 810 nt11.31□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 UTP6YDR449C 1323 nt11.31□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 ARP10YDR106W 855 nt11.3□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 YDR509WYDR509W 348 nt11.3□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 YPL071CYPL071C 471 nt11.3□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 MET28YIR017C 564 nt11.29□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 MSB4YOL112W 1479 nt11.29□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 YPL041CYPL041C 624 nt11.28□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 FTH1YBR207W 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
TYW1Q08960 GND1YHR183W 1470 nt11.25□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 PAU5YFL020C 369 nt11.25□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 TIM44YIL022W 1296 nt11.25□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 SEM1YDR363W-A 270 nt11.24□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 DUT1YBR252W 444 nt11.24□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 FRE6YLL051C 2139 nt11.24□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 YJL064WYJL064W 396 nt11.22□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 YML089CYML089C 369 nt11.22□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 BOP3YNL042W 1191 nt11.22□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 APT2YDR441C 546 nt11.21□□□□□ -0.61
TYW1Q08960 POM34YLR018C 900 nt11.2□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 NBP35YGL091C 987 nt11.19□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 FIT3YOR383C 615 nt11.19□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 PGC1YPL206C 966 nt11.19□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 TAT1YBR069C 1860 nt11.18□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 RIB1YBL033C 1038 nt11.17□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 PCH2YBR186W 1695 nt11.17□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 SLG1YOR008C 1137 nt11.16□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 YBR232CYBR232C 360 nt11.16□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 ATG15YCR068W 1563 nt11.16□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 PAU19YMR325W 375 nt11.15□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 TIF6YPR016C 738 nt11.15□□□□□ -0.62
TYW1Q08960 PRO1YDR300C 1287 nt11.14□□□□□ -0.63
TYW1Q08960 STP3YLR375W 1032 nt11.14□□□□□ -0.63
TYW1Q08960 ERG6YML008C 1152 nt11.11□□□□□ -0.63
TYW1Q08960 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.09□□□□□ -0.63
TYW1Q08960 SOD2YHR008C 702 nt11.09□□□□□ -0.63
TYW1Q08960 RIB2YOL066C 1776 nt11.08□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 RTF1YGL244W 1677 nt11.08□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 Q0144Q0144 330 nt11.08□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 SMM1YNR015W 1155 nt11.08□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 LSC2YGR244C 1284 nt11.07□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 AGP1YCL025C 1902 nt11.06□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 SKG1YKR100C 1068 nt11.06□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 AQY2YLL052C 450 nt11.03□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 YTH1YPR107C 627 nt11.03□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 GUT2YIL155C 1950 nt11.03□□□□□ -0.64
TYW1Q08960 YIA6YIL006W 1122 nt11□□□□□ -0.65
TYW1Q08960 DUS1YML080W 1272 nt11□□□□□ -0.65
TYW1Q08960 TIP1YBR067C 633 nt11□□□□□ -0.65
TYW1Q08960 BNS1YGR230W 414 nt10.99□□□□□ -0.65
TYW1Q08960 PUS5YLR165C 765 nt10.96□□□□□ -0.65
TYW1Q08960 CCA1YER168C 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
TYW1Q08960 ALD4YOR374W 1560 nt10.94□□□□□ -0.66
TYW1Q08960 snR78snR78 87 nt10.94□□□□□ -0.66
TYW1Q08960 VRG4YGL225W 1014 nt10.94□□□□□ -0.66
TYW1Q08960 FHN1YGR131W 525 nt10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1391.1 ms