Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD47Q08722 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD47Q08722 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD47Q08722 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD47Q08722 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD47Q08722 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD47Q08722 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD47Q08722 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD47Q08722 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD47Q08722 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD47Q08722 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD47Q08722 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD47Q08722 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD47Q08722 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD47Q08722 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD47Q08722 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD47Q08722 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD47Q08722 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD47Q08722 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD47Q08722 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD47Q08722 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD47Q08722 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD47Q08722 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD47Q08722 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD47Q08722 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD47Q08722 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD47Q08722 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD47Q08722 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD47Q08722 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD47Q08722 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD47Q08722 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD47Q08722 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD47Q08722 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD47Q08722 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD47Q08722 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD47Q08722 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD47Q08722 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD47Q08722 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD47Q08722 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD47Q08722 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD47Q08722 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD47Q08722 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD47Q08722 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD47Q08722 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD47Q08722 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD47Q08722 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD47Q08722 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD47Q08722 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD47Q08722 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD47Q08722 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD47Q08722 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD47Q08722 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD47Q08722 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD47Q08722 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD47Q08722 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD47Q08722 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD47Q08722 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD47Q08722 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD47Q08722 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD47Q08722 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD47Q08722 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD47Q08722 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD47Q08722 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD47Q08722 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD47Q08722 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD47Q08722 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD47Q08722 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD47Q08722 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD47Q08722 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD47Q08722 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD47Q08722 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD47Q08722 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD47Q08722 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD47Q08722 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD47Q08722 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD47Q08722 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD47Q08722 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD47Q08722 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD47Q08722 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD47Q08722 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD47Q08722 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD47Q08722 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD47Q08722 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD47Q08722 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD47Q08722 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD47Q08722 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD47Q08722 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD47Q08722 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD47Q08722 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD47Q08722 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD47Q08722 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD47Q08722 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD47Q08722 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD47Q08722 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms