Protein–RNA interactions for Protein: Q03579

LIP1, Ceramide synthase subunit LIP1, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LIP1Q03579 GNP1YDR508C 1992 nt6.18□□□□□ -1.42
LIP1Q03579 VPS60YDR486C 690 nt6.18□□□□□ -1.42
LIP1Q03579 YKR040CYKR040C 504 nt6.17□□□□□ -1.42
LIP1Q03579 ALD5YER073W 1563 nt6.17□□□□□ -1.42
LIP1Q03579 YOR325WYOR325W 474 nt6.15□□□□□ -1.42
LIP1Q03579 PUS2YGL063W 1113 nt6.14□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 SAM35YHR083W 990 nt6.14□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt6.14□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 YDR306CYDR306C 1437 nt6.14□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 OPI10YOL032W 741 nt6.13□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 ALG3YBL082C 1377 nt6.13□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 CCT4YDL143W 1587 nt6.13□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 DMA2YNL116W 1569 nt6.13□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 ERV46YAL042W 1248 nt6.12□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 ARO8YGL202W 1503 nt6.11□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 SGA1YIL099W 1650 nt6.1□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 YOR139CYOR139C 393 nt6.1□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 SWC5YBR231C 912 nt6.1□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 UTR1YJR049C 1593 nt6.1□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 KES1YPL145C 1305 nt6.09□□□□□ -1.43
LIP1Q03579 YLR173WYLR173W 1827 nt6.09□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 PCP1YGR101W 1041 nt6.08□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 RSC8YFR037C 1674 nt6.07□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YHR218WYHR218W 1812 nt6.06□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 TOM71YHR117W 1920 nt6.06□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 NBP35YGL091C 987 nt6.06□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YLR179CYLR179C 606 nt6.06□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 DAT1YML113W 747 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 TIM23YNR017W 669 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 CCT2YIL142W 1584 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.05□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 MEP3YPR138C 1470 nt6.04□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YOR072WYOR072W 315 nt6.04□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 ZAP1YJL056C 2643 nt6.04□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 YLR235CYLR235C 399 nt6.03□□□□□ -1.44
LIP1Q03579 AHT1YHR093W 549 nt6.01□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 RTG2YGL252C 1767 nt6.01□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 TPN1YGL186C 1740 nt6□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 TAD3YLR316C 969 nt6□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 YPR011CYPR011C 981 nt6□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 BET2YPR176C 978 nt6□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 DBP1YPL119C 1854 nt6□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 HXT1YHR094C 1713 nt5.99□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 SHY1YGR112W 1170 nt5.99□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 LSB6YJL100W 1824 nt5.99□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 GAP1YKR039W 1809 nt5.98□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 YCR102CYCR102C 1107 nt5.98□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 CWC15YDR163W 528 nt5.98□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 ODC1YPL134C 933 nt5.98□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 MTO1YGL236C 2010 nt5.98□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 PTH1YHR189W 573 nt5.97□□□□□ -1.45
LIP1Q03579 SNU66YOR308C 1764 nt5.96□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 LSC2YGR244C 1284 nt5.96□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 YPR064WYPR064W 420 nt5.96□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 SHM2YLR058C 1410 nt5.95□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 PUS7YOR243C 2031 nt5.94□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 ADE2YOR128C 1716 nt5.94□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 MRP20YDR405W 792 nt5.94□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 MEX67YPL169C 1800 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 IMT4tM(CAU)E 72 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 IMT3tM(CAU)J3 72 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 IMT1tM(CAU)O1 72 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 IMT2tM(CAU)P 72 nt5.93□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 MDL2YPL270W 2322 nt5.92□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 URA6YKL024C 615 nt5.92□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 MDM35YKL053C-A 261 nt5.92□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 SSL2YIL143C 2532 nt5.91□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 SFL1YOR140W 2301 nt5.91□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 NBA1YOL070C 1506 nt5.91□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 QDR2YIL121W 1629 nt5.9□□□□□ -1.46
LIP1Q03579 HXT10YFL011W 1641 nt5.89□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 ALR1YOL130W 2580 nt5.89□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 TIM17YJL143W 477 nt5.89□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 THI6YPL214C 1623 nt5.88□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 NIT1YIL164C 600 nt5.88□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 TIR3YIL011W 810 nt5.87□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 YKL030WYKL030W 606 nt5.87□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 DIG1YPL049C 1359 nt5.86□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 RBG1YAL036C 1110 nt5.86□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 CWP2YKL096W-A 279 nt5.86□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 SHB17YKR043C 816 nt5.86□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 GCD11YER025W 1584 nt5.85□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 YBL086CYBL086C 1401 nt5.85□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 GID8YMR135C 1368 nt5.85□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 YLR415CYLR415C 339 nt5.85□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 DIF1YLR437C 402 nt5.85□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 SBA1YKL117W 651 nt5.84□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 YMR244WYMR244W 1068 nt5.84□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 PHO23YNL097C 993 nt5.84□□□□□ -1.47
LIP1Q03579 DAK2YFL053W 1776 nt5.83□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 UFO1YML088W 2007 nt5.83□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 ZTA1YBR046C 1005 nt5.83□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 MAM3YOL060C 2121 nt5.83□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 ACH1YBL015W 1581 nt5.82□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 PRO1YDR300C 1287 nt5.82□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 PET8YNL003C 855 nt5.82□□□□□ -1.48
LIP1Q03579 LSR1LSR1 1175 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms