Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFITM3Q01628 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFITM3Q01628 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFITM3Q01628 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
IFITM3Q01628 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFITM3Q01628 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFITM3Q01628 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFITM3Q01628 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFITM3Q01628 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFITM3Q01628 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms