Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1BQ00975 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1BQ00975 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1BQ00975 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1BQ00975 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1BQ00975 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1BQ00975 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1BQ00975 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1BQ00975 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1BQ00975 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1BQ00975 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1BQ00975 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms