Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS25P62851 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS25P62851 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS25P62851 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS25P62851 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS25P62851 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS25P62851 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS25P62851 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS25P62851 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS25P62851 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS25P62851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS25P62851 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS25P62851 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS25P62851 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS25P62851 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS25P62851 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS25P62851 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS25P62851 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS25P62851 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS25P62851 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS25P62851 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS25P62851 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS25P62851 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS25P62851 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS25P62851 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS25P62851 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS25P62851 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS25P62851 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS25P62851 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS25P62851 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS25P62851 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS25P62851 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS25P62851 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS25P62851 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS25P62851 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS25P62851 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS25P62851 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS25P62851 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS25P62851 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS25P62851 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS25P62851 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS25P62851 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS25P62851 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS25P62851 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS25P62851 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS25P62851 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS25P62851 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS25P62851 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS25P62851 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS25P62851 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS25P62851 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS25P62851 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS25P62851 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS25P62851 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS25P62851 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS25P62851 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS25P62851 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS25P62851 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS25P62851 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS25P62851 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS25P62851 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS25P62851 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS25P62851 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS25P62851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS25P62851 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS25P62851 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS25P62851 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS25P62851 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS25P62851 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS25P62851 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS25P62851 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS25P62851 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS25P62851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS25P62851 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS25P62851 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS25P62851 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS25P62851 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS25P62851 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS25P62851 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS25P62851 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS25P62851 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS25P62851 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS25P62851 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS25P62851 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS25P62851 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS25P62851 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS25P62851 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS25P62851 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS25P62851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS25P62851 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS25P62851 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS25P62851 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS25P62851 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms