Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVFC1-1P60608 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFC1-1P60608 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFC1-1P60608 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFC1-1P60608 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVFC1-1P60608 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms