Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S2P59780 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3S2P59780 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3S2P59780 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3S2P59780 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S2P59780 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S2P59780 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3S2P59780 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms