Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00310P59036 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00310P59036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00310P59036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00310P59036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00310P59036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00310P59036 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms